Carlos Fernández de Henestrosa ha desarrollado una destacada labor como Director-Gerente de la Fundación Colección Thyssen-Bormemisza durante los últimos 10 años, desde abril de 1997. Entre sus logros profesionales más destacados en esta etapa, se incluye su contribución a que el Museo Thyssen haya ampliado sustancialmente el número y la calidad de las visitas mereciendo la más alta valoración entre los grandes museos internacionales.

La Dirección Adjunta de Administración del Museo del Prado tiene a su cargo las áreas de seguridad, finanzas, recursos humanos, obras y mantenimiento y atención al visitante y participa, en coordinación con la Dirección Adjunta de Conservación e Investigación, en el desarrollo de los planes de actuación del organismo.